"Смутное время" - особая страница в тысячелетней летописи Ярославля. Важное место в этой истории занимает ансамбль Спасо-Преображенского монастыря в Ярославле.
Именно здесь была наиболее надежная цитадель города. Крепость монастыря имела мощные укрепления, что позволило выдержать 24-дневную осаду польских интервентов.
В дальнейшем от стен монастыря двинулся поход ополчения земского старосты Козьмы Минина и новгородского князя Дмитрия Пожарского на освобождение Москвы.
На территории музея-заповедника установлен памятник-стела «Клятва князя Пожарского». Это стела, посвящённая 1000-летию основания Ярославля, на которой изображена одноимённая картина В. И. Нестеренко.

Часовня, посвященная иконе Казанской Богоматери, открыта в 1997 в память о 385-летии народного ополчения, избавившего Россию от польско-литовского вторжения.

Это еще один ярославский монастырь, связанный с событиями Смутного времени и пребыванием в городе знаменитого ополчения Минина и Пожарского.  Именно в этой обители хранилась чудотворная икона Спаса Нерукотворного, по преданию, защитившая ополченцев и горожан от страшной болезни. 
На территории Афанасиевского монастыря в прошлом году был торжественно открыт памятник народным героям – Минину и Пожарскому.
В этом году в День народного единства в Ярославле произошло великое событие – торжественная передача вновь обретённой, отреставрированной иконы Спаса Нерукотворного в монастырь.

Принято считать, что Ярославский храм Николы Надеина был построен как памятник участию ярославцев в деле изгнания поляков из Москвы и в память об обороне Ярославля.